More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0598 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 553 aa  1120    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 559 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 551 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 556 aa  465  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 586 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 551 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 546 aa  455  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 551 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 589 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 585 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 589 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 592 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 564 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 559 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 586 aa  432  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0414  arginyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 539 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 559 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 598 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 560 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 549 aa  425  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 561 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 561 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 588 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 584 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1495  arginyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 543 aa  415  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 553 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 579 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2767  arginyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 583 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0538697 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 553 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 592 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 611 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 579 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 575 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 586 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 563 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 562 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 581 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1372  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 583 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 587 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 583 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 567 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1507  arginyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 575 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164187  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 562 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 577 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 556 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 569 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 580 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 570 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0276  arginyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 598 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 561 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>