More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0295 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  69.81 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  68.55 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  67.3 
 
 		 157 aa  221  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  64.15 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  62.26 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  69.33 
 
 		 155 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  61.64 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0261  30S ribosomal protein S7  63.75 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  60.38 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  67.33 
 
 		 155 aa  207  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  67.33 
 
 		 155 aa  207  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  62.89 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  60.38 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  61.64 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  60.38 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  60.38 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  58.6 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  61.01 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  60.38 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  62.26 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.23 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  57.23 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  58.6 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  56.69 
 
 		 155 aa  194  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  59.12 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  55.35 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 156 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  55.35 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  55.97 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  55.97 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  60.38 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  55.97 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  55.97 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  59.12 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  54.72 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  57.23 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  57.23 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  57.23 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  55.35 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  55.97 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  55.97 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  55.97 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  55.9 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  57.23 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  56.25 
 
 		 157 aa  191  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  56.6 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  57.23 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  55.35 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  59.75 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  55.35 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1336  ribosomal protein S7  57.86 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  54.72 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  57.23 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>