More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1615 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  71.43 
 
 
304 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  68.32 
 
 
308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  59.15 
 
 
315 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  59.15 
 
 
318 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  58.69 
 
 
311 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  56.72 
 
 
311 aa  363  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  56.72 
 
 
311 aa  363  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  57.1 
 
 
318 aa  362  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  56.95 
 
 
317 aa  361  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  55.92 
 
 
310 aa  358  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  57.1 
 
 
318 aa  358  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  57.43 
 
 
321 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  57.43 
 
 
321 aa  358  8e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  57.43 
 
 
321 aa  358  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  57.43 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  57.43 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  57.43 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  57.43 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  56.77 
 
 
318 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  56.77 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  55.12 
 
 
310 aa  346  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  52.63 
 
 
313 aa  324  1e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
304 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  48.18 
 
 
309 aa  295  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  47.19 
 
 
304 aa  295  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  49.18 
 
 
323 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  46.51 
 
 
308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  47.74 
 
 
409 aa  288  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  48.53 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  49.83 
 
 
396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  48.17 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  48.68 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  49.34 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  47.68 
 
 
310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  48.33 
 
 
306 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  46.56 
 
 
334 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  47.83 
 
 
320 aa  278  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  53.56 
 
 
306 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  46.2 
 
 
309 aa  276  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  49.32 
 
 
317 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  48.97 
 
 
317 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  46.2 
 
 
312 aa  267  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  47.02 
 
 
308 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  47.35 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  49.82 
 
 
307 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  48.84 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  43.71 
 
 
334 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  44.74 
 
 
311 aa  262  6e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  46 
 
 
313 aa  261  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  46.05 
 
 
306 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  45.42 
 
 
348 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  44.15 
 
 
324 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  44.81 
 
 
313 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  45.6 
 
 
340 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  46.53 
 
 
304 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  46.6 
 
 
321 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  47.83 
 
 
320 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  47.87 
 
 
309 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  44.7 
 
 
310 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  46.03 
 
 
336 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  46.28 
 
 
327 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
333 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
333 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  45.7 
 
 
302 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
333 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  47.14 
 
 
316 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  43.79 
 
 
318 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.88 
 
 
311 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  46.18 
 
 
318 aa  254  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  43.85 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  43.42 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  44.92 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  45.51 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  43.04 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  46.03 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.85 
 
 
427 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  43.75 
 
 
311 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  44.66 
 
 
346 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  44.82 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  46.08 
 
 
308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  48.25 
 
 
317 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  43.42 
 
 
311 aa  251  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.08 
 
 
407 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  43.38 
 
 
332 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  44.92 
 
 
311 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  44.59 
 
 
311 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  46.53 
 
 
325 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
310 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  42.02 
 
 
310 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.85 
 
 
320 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
311 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  44.41 
 
 
329 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  41.94 
 
 
333 aa  249  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  44.88 
 
 
307 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  41.97 
 
 
359 aa  248  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  43.19 
 
 
321 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  47.9 
 
 
362 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25220  thioredoxin-disulfide reductase  46.77 
 
 
313 aa  247  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000419952  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  42.35 
 
 
330 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>