More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1135 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  86.99 
 
 
398 aa  711    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
397 aa  801    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  75.63 
 
 
399 aa  617  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  74.49 
 
 
395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  71.32 
 
 
402 aa  577  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  69.37 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  68.37 
 
 
395 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  68.88 
 
 
403 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  70.33 
 
 
399 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  68.03 
 
 
403 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  69.57 
 
 
399 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
399 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
398 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
398 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  68.13 
 
 
396 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
396 aa  541  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  67.18 
 
 
395 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  65.64 
 
 
396 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
396 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  64.38 
 
 
396 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  66.24 
 
 
397 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
402 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  65.55 
 
 
393 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  63.08 
 
 
396 aa  522  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 
406 aa  518  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  65.55 
 
 
391 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  65.55 
 
 
391 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  61.36 
 
 
406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 
405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  63.13 
 
 
414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  62.92 
 
 
395 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
395 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
403 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
403 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 
405 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
396 aa  501  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  61.22 
 
 
396 aa  500  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  60.61 
 
 
405 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  61.11 
 
 
402 aa  495  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.64 
 
 
395 aa  495  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  59.28 
 
 
393 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  62.05 
 
 
381 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  61.77 
 
 
396 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  60.91 
 
 
387 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  59.05 
 
 
401 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  60.19 
 
 
420 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  60.96 
 
 
402 aa  489  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  61.64 
 
 
383 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 
388 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 
391 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  59.85 
 
 
400 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 
388 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 
397 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 
382 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 
399 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  58.98 
 
 
421 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
398 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  59.06 
 
 
402 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
402 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
402 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
402 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 
391 aa  473  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  59.39 
 
 
389 aa  471  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  58.15 
 
 
422 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  60.2 
 
 
411 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 
417 aa  471  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  58.54 
 
 
418 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 
397 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 
408 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  57.66 
 
 
420 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  58.15 
 
 
422 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
390 aa  471  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
398 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  59.01 
 
 
402 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  60.15 
 
 
399 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0675  methionine adenosyltransferase  60.67 
 
 
401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  59.34 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  58.29 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  59.34 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  58.82 
 
 
384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  60.91 
 
 
387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  59.34 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  60.91 
 
 
387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  59.85 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1697  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  59.14 
 
 
411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>