More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2962 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 452 aa  866    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.74 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.96 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.81 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.59 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.3 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 		 433 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.77 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  44.7 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.21 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.51 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.93 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.89 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.12 
 
 		 433 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.12 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  44.05 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.39 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.68 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.39 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.39 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  44.07 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.39 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.21 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.54 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.54 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.39 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  43.89 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.17 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.92 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  42.95 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.71 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  45.88 
 
 		 456 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  43.02 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.38 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.29 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.95 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  43.17 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.29 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  42.95 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  42.95 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  42.95 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  42.95 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.12 
 
 		 430 aa  329  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.54 
 
 		 452 aa  329  7e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  42.73 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  43.17 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  42.95 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.7 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  43.17 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.18 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  42.64 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.56 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.92 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.06 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.93 
 
 		 438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  40.79 
 
 		 444 aa  325  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.29 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.4 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.63 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.63 
 
 		 441 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.74 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.16 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.32 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4526  xanthine/uracil permease family protein  42.32 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.190363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.88 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  42.54 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.4 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.67 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.87 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0666  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.87 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0631  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.87 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000126006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.29 
 
 		 429 aa  318  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.65 
 
 		 491 aa  318  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.15 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  42.28 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0474  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.1 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.28 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.2 
 
 		 454 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.48 
 
 		 432 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.45 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.4 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.02 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.95 
 
 		 433 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  43.18 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  41.83 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  42.06 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.63 
 
 		 515 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  41.63 
 
 		 429 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.91 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>