More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1659 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 543 aa  1086    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 557 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 550 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 556 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 556 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 553 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 586 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 561 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 562 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 559 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 554 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 554 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 558 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 561 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 550 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 596 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 561 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 596 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 586 aa  399  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 557 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 585 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 577 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 602 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 564 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 564 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 587 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 546 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 546 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2484  arginyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00470527  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 550 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 589 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 595 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 575 aa  388  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 575 aa  388  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>