More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1182 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
228 aa  447  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  55.07 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  55.75 
 
 
260 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  53.74 
 
 
253 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 
301 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
340 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
232 aa  124  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
327 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  43.6 
 
 
237 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
319 aa  118  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
226 aa  118  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
340 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
228 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  43.21 
 
 
362 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
242 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
340 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
336 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
230 aa  112  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
229 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
242 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  36.5 
 
 
293 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  40.81 
 
 
252 aa  111  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  36.7 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
354 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
229 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
227 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
271 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
349 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
685 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 
227 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
237 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
245 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
230 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
346 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
244 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
230 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
245 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
230 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  43.13 
 
 
245 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  37.5 
 
 
749 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
336 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  37.18 
 
 
257 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 
226 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
242 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 
374 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
230 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
234 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
235 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 
307 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
227 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  36.12 
 
 
227 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
235 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
230 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
249 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 
236 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
355 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
285 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
394 aa  99  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  31.03 
 
 
328 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
238 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
448 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
351 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
393 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.09 
 
 
382 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
385 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1024  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
268 aa  95.5  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.708512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
298 aa  95.5  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  29.67 
 
 
333 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  32.46 
 
 
531 aa  95.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
313 aa  94.7  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.73 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
279 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32 
 
 
321 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>