86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3481 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  850    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  52.72 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  53.78 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  49.89 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  52.07 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  52.94 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  46.58 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  46.84 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  49.38 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  47.22 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  47.26 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  46.61 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  48.61 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  46.95 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  46.55 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  44.35 
 
 		 489 aa  350  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  47.65 
 
 		 484 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  46.86 
 
 		 483 aa  345  7e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  41.8 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  41.57 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  45.35 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  42.92 
 
 		 466 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  43.13 
 
 		 479 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  45.22 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  43.43 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  41.87 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  41.87 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  43.64 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  43.43 
 
 		 466 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  44.44 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  44.77 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  43.6 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  43.98 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  42.29 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  44.22 
 
 		 463 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  44.79 
 
 		 463 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  44.14 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  41.43 
 
 		 463 aa  296  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  42.16 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  42.14 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  39.96 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  44.14 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  44.18 
 
 		 463 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  39.52 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  41.92 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  40.79 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  42.89 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  40.59 
 
 		 479 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  40.59 
 
 		 479 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  40.59 
 
 		 479 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  40.59 
 
 		 479 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  40.17 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  44.03 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  39.96 
 
 		 479 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  39.5 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  43.82 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  42.35 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  40 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  42.42 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  41.99 
 
 		 467 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  41.99 
 
 		 467 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  40.26 
 
 		 479 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  41.56 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  41.81 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  41.27 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  41.27 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  39.83 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  42.01 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  41.05 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  58.96 
 
 		 521 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  37.41 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  37.78 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  38.99 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  44.13 
 
 		 428 aa  144  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  47.75 
 
 		 141 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  47.75 
 
 		 141 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  47.75 
 
 		 141 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  47.75 
 
 		 141 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>