More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1963 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1963  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 433 aa  864    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.700985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  53.35 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4343  adenylosuccinate lyase  53.35 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.119583  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1769  adenylosuccinate lyase  52.42 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.468404  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  53.12 
 
 		 435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  52.89 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  51.03 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  52.31 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  51.5 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  52.3 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  50.92 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  51.36 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3019  adenylosuccinate lyase  52.82 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.472154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1068  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0025797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  50.46 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  53.68 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  51.15 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  47.44 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  51.73 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1036  adenylosuccinate lyase  49.54 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  52.42 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  51.73 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  49.42 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  48.73 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1610  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  53.32 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3849  adenylosuccinate lyase  52.8 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  45.12 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0179  adenylosuccinate lyase  52.05 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0644035  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  44.34 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  49.19 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2663  adenylosuccinate lyase  50.72 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139235 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  45.82 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  45.35 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  49.64 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  51.57 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  49.64 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0059  adenylosuccinate lyase  47.39 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.169461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  45.24 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  46.4 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  45.58 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  47.1 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  45.43 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  48.92 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  48.92 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  48.22 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  45.43 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  47.21 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  45.95 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  44.5 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15851  adenylosuccinate lyase  46.7 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  47.8 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  46.3 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  47.82 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0996  adenylosuccinate lyase  46.34 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.134084  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  46.79 
 
 		 431 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  49.75 
 
 		 431 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  46.9 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  45.39 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  48.22 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  47.56 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18651  adenylosuccinate lyase  46.34 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  46.9 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  47.83 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  48.24 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  45.52 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  44.96 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  47.14 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  45.95 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  40.75 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  45.2 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  45.22 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  46.5 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  46.45 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  44.96 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  45.32 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  44.58 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  45.95 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  42.2 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>