More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1413 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.97 
 
 		 253 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  53.5 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  54.13 
 
 		 274 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  54.32 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  50.61 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  51.65 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  51.22 
 
 		 275 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.2 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  48.98 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  52.4 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  50.2 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.82 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  51.23 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  50.41 
 
 		 266 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0086  hypothetical protein  46.19 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0071  hypothetical protein  46.19 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0112  hypothetical protein  46.19 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  47.18 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  47.24 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  45.9 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1454  cysteine-rich domain protein  44.92 
 
 		 245 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00283589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  46.69 
 
 		 266 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.46 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.06 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.49 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0884  hypothetical protein  42.37 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.12 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.26 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.33 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  43.4 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  42.26 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  41.35 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.77 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.77 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  43.27 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  42.28 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  43.57 
 
 		 268 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  42.98 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  42.68 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  40.17 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  41.87 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  41.87 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  41.87 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  41.87 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  41.87 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  39.74 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  42.02 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.6 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.55 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.55 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  39.32 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  42.98 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  39.32 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  42.13 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  42.49 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  42.13 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  42.13 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  42.13 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  42.13 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  42.13 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  41.7 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  42.55 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.13 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  40.24 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  40.59 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  41.7 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  41.7 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  41.63 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.85 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.7 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  41.7 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  41.28 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.74 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  40.68 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1397  hypothetical protein  40.89 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  40.08 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  40.51 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  38.78 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.34 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  39.75 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.84 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  40.85 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  39.17 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  40.5 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.7 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.08 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.25 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.94 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.08 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  43.28 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  38.68 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>