172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0379 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0379  flavodoxin FldA  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  68.55 
 
 		 160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  64.78 
 
 		 160 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2656  flavodoxin FldA  65.41 
 
 		 160 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  64.78 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0832  flavodoxin FldA  65.41 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  59.75 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  47.5 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  46.88 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0079  flavodoxin  45.34 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  51.13 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  47.2 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  41.88 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  44.38 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  46.2 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  44.38 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  45 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  45.28 
 
 		 209 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  45.28 
 
 		 209 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  45.28 
 
 		 209 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  44.1 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  45.91 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  45.28 
 
 		 176 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  45.28 
 
 		 176 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  46.25 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  43.48 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  43.12 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  43.83 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  43.83 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  43.83 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  43.83 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  43.83 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  43.12 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  43.83 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  42.14 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  43.12 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  43.83 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  43.83 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  43.83 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  43.67 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  44.94 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  43.12 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  42.77 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  40.49 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  43.75 
 
 		 194 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  42.24 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  42.24 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  41.88 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  43.12 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  43.12 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  40.76 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  39.62 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23658  flavodoxin  44.38 
 
 		 207 aa  124  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  40.88 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  40.85 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  42.68 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  43.67 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  40.99 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  40 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  40.25 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  41.51 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  40.88 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  39.63 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  41.88 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  39.62 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000503169  decreased coverage  0.0000000000344478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  38.99 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  39.63 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  40.25 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  40.25 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  40.25 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  39.63 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  39.62 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  39.62 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  39.62 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  39.62 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_002950  PG1858  flavodoxin FldA  40.65 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  39.52 
 
 		 180 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  40.72 
 
 		 180 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  39.63 
 
 		 173 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  39.02 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  39.75 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  39.62 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  40.85 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  40.85 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  41.32 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  40.85 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  40.85 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  40.85 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  39.62 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  40.74 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  40.24 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  40.24 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  39.13 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>