127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1513 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 94 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  60.92 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  58.24 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 93 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  57.14 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  54.95 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  52.75 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  51.76 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  49.41 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  51.16 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  50.59 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  47.13 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  48.24 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  44.32 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  45.05 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  48.19 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  45.05 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  48.75 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  46.99 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  46.99 
 
 		 83 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  44.32 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  42.22 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  43.37 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  44.58 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  41.38 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  41.38 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  44.05 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  44.32 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  43.18 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  43.18 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  43.18 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  43.18 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  43.18 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  48.1 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  40 
 
 		 453 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  40.45 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  37.63 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  43.02 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  44.71 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  37.36 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1796  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  40 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  41.46 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  36.78 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  44.05 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  39.08 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  36.9 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  39.02 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  39.02 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4083  PAAR  43.04 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  34.48 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  44.3 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  37.36 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  37.36 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  37.36 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  37.36 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  35.48 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  39.24 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  37.65 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  33.72 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  35.06 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  35.37 
 
 		 592 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  35.06 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6532  PAAR repeat-containing protein  50.94 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  30.61 
 
 		 466 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  32.93 
 
 		 540 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  35 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  35 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  34 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  34 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  33.67 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  34 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  39.13 
 
 		 469 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  34.52 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  34.52 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  34.52 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  32.65 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  34 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  34 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  34 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  34 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  36.25 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>