75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1677 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  62.07 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  57.78 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  56.98 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  56.67 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  55.56 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  53.33 
 
 		 92 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  51.16 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  46.59 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  44.71 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  44.05 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  45.78 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  46.91 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  44.58 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  41.38 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  44.58 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  44.58 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  40.23 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  43.37 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  39.76 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  41.67 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  41.67 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  35.96 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  38.55 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  38.55 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  37.08 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  38.2 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  40.23 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  40.96 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  39.33 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  39.33 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  40.66 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  38.37 
 
 		 453 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  36.78 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  38.64 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  38.64 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  38.1 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  38.1 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  39.77 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  38.2 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  38.2 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  38.2 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  38.2 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  38.2 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  39.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  38.75 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  36.9 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  36.9 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  38.03 
 
 		 466 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  38.71 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>