57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0004 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  65.75 
 
 
86 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  55.22 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  46.48 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  46.58 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  45.21 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  41.33 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  46.05 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  34.78 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  34.95 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  42.67 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  43.84 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  39.73 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  42.25 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  39.73 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  39.73 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  40 
 
 
88 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  36.92 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  45.21 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  45.21 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  45.21 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  40.32 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  45.21 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  45.21 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  45.21 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  45.21 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
466 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  34.33 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  40.3 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  37.68 
 
 
855 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  36.23 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  36.99 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  35.14 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  34.29 
 
 
453 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  41.43 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  40 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  35 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  40.35 
 
 
469 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  37.84 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  37.14 
 
 
592 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  35.14 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  36.67 
 
 
540 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  35.14 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  30.67 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  39.71 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  38.24 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  41.82 
 
 
481 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  36.49 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  35.82 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  36.49 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  38.24 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  38.24 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  41.43 
 
 
176 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>