More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5038 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 		 150 aa  313  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  91.33 
 
 		 150 aa  290  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  66 
 
 		 150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  63.76 
 
 		 166 aa  206  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  62.67 
 
 		 169 aa  204  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  61.33 
 
 		 150 aa  202  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  63.09 
 
 		 154 aa  197  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  60.67 
 
 		 150 aa  196  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  61.33 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  57.33 
 
 		 159 aa  184  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  54.67 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  55.41 
 
 		 149 aa  179  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  60.81 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  54.67 
 
 		 153 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  54.67 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  53.33 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  54 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  52.38 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  51.01 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  53.74 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  52.35 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  55.17 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  53.38 
 
 		 169 aa  166  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  52.7 
 
 		 185 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  50.68 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  50.68 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  50.68 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  50.68 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  50 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  50.34 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  49.32 
 
 		 177 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  48.63 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  46.62 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  48.99 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  47.3 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  45.95 
 
 		 186 aa  144  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  48.59 
 
 		 168 aa  143  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  45.21 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  44.97 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  46 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  46.9 
 
 		 172 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  46.9 
 
 		 172 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  49.01 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  46.15 
 
 		 176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  45.21 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  45.21 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  45.75 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  46.62 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  46.62 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  46.62 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  46.62 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  46.62 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  46.62 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  46.62 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  46.58 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  44.52 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  43.84 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  45.58 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  41.78 
 
 		 199 aa  128  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  43.92 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  45.27 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  45.89 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  45.89 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  45.89 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  44.22 
 
 		 169 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  45.21 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  43.54 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  41.5 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  43.54 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  43.92 
 
 		 216 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  43.92 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  43.92 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  45.52 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  40.82 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  43.84 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  42.47 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  44.78 
 
 		 184 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 		 169 aa  116  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  40.82 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  44.59 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  41.78 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  41.78 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  42.47 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  36.99 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  38.62 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  41.61 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  38.93 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  38.31 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  35.14 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  35.71 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  39.86 
 
 		 348 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  33.1 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  35.81 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  34.25 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  32.03 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  33.57 
 
 		 171 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  36.73 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  35.57 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  36.99 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  33.79 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.090067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>