31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1325 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  79.51 
 
 		 332 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  78.85 
 
 		 331 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  76.06 
 
 		 336 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  69.35 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  69.75 
 
 		 330 aa  437  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  65.96 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  38.05 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  35.44 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  36.01 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  26.98 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  36.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  26.23 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  35 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  33.09 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  31.96 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  32.56 
 
 		 234 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  35.56 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  25.58 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  31.82 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  29.1 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  30.6 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  32.94 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  35.37 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  31.9 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  26.67 
 
 		 229 aa  42.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>