More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0588 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
407 aa  780  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  69.19 
 
 
430 aa  514  1e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  71.06 
 
 
415 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  59.2 
 
 
412 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  61.31 
 
 
407 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  61.31 
 
 
407 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  60.67 
 
 
404 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.02 
 
 
408 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.02 
 
 
408 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.51 
 
 
403 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  54.82 
 
 
401 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  52.67 
 
 
402 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  57.29 
 
 
388 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03685e-05 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  55.42 
 
 
413 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  59.28 
 
 
405 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  57.67 
 
 
401 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  57.67 
 
 
401 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  57.67 
 
 
401 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  57.7 
 
 
396 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.93 
 
 
411 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.93 
 
 
411 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  55.28 
 
 
403 aa  362  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  57.22 
 
 
417 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  59.14 
 
 
426 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  54.61 
 
 
425 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  50 
 
 
397 aa  359  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  53.79 
 
 
411 aa  358  1e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  55.73 
 
 
403 aa  358  1e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  58.2 
 
 
403 aa  355  9e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  50.13 
 
 
393 aa  353  3e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  53.32 
 
 
401 aa  353  3e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  54.36 
 
 
409 aa  352  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  56.8 
 
 
408 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  57.03 
 
 
403 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  56.88 
 
 
401 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  57.03 
 
 
403 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  56.61 
 
 
401 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  55.22 
 
 
408 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  55.06 
 
 
412 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  54.8 
 
 
398 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  50.89 
 
 
393 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31811e-11 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3452  hypothetical protein  59.49 
 
 
405 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758612  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  52.23 
 
 
393 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  51.82 
 
 
393 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.61 
 
 
391 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  50.92 
 
 
393 aa  337  2e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  55.83 
 
 
404 aa  337  3e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  50.13 
 
 
393 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01188e-09 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  50.13 
 
 
393 aa  332  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.16 
 
 
400 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  49.87 
 
 
393 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  56.46 
 
 
392 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  49.62 
 
 
393 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.71 
 
 
405 aa  320  2e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  54.89 
 
 
401 aa  320  4e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  55.56 
 
 
401 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  50.13 
 
 
393 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  53.23 
 
 
430 aa  318  8e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.05 
 
 
411 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  56.14 
 
 
392 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  60.57 
 
 
398 aa  315  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.18 
 
 
443 aa  310  3e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.96 
 
 
407 aa  298  9e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  48.57 
 
 
394 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  44.5 
 
 
383 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.21 
 
 
404 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  49.61 
 
 
394 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  50.16 
 
 
346 aa  283  5e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  54.26 
 
 
407 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  42.97 
 
 
395 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  43.87 
 
 
383 aa  259  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  43.31 
 
 
386 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  50.71 
 
 
387 aa  255  1e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  41.93 
 
 
383 aa  253  5e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  45.41 
 
 
383 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  44.19 
 
 
378 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  53.56 
 
 
330 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  42.96 
 
 
390 aa  244  1e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  42.86 
 
 
390 aa  242  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  43.08 
 
 
390 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  42.82 
 
 
390 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  44.32 
 
 
380 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  42.39 
 
 
392 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  43.34 
 
 
379 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  43.78 
 
 
390 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  44.86 
 
 
418 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  46.93 
 
 
381 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.86 
 
 
418 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  44.59 
 
 
418 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  44.86 
 
 
382 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  43.49 
 
 
387 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  44.68 
 
 
402 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  39.39 
 
 
404 aa  222  1e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  47.36 
 
 
416 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  35.37 
 
 
493 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03341  chromate ion transporter (Eurofung)  32.38 
 
 
510 aa  164  4e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.156083  normal  0.912193 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.57 
 
 
386 aa  163  4e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  53.42 
 
 
158 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  31.89 
 
 
476 aa  152  9e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  31.47 
 
 
389 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>