More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0075 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 442 aa  874    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  85.68 
 
 		 448 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  82.37 
 
 		 448 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  70.36 
 
 		 442 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  73.32 
 
 		 447 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  70.39 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  68.9 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  58.06 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  56.22 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  58.89 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  56.32 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  56.22 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  56.91 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  57.14 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  52.62 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  55.99 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  50.58 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  51.05 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  52.35 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  52.72 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  52.21 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  49.2 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  49.2 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  49.07 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  53.07 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  48.74 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  52.61 
 
 		 412 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  54.23 
 
 		 422 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  53.19 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  51.54 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  49.44 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  47.95 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  44.03 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  45.61 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  46.06 
 
 		 467 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  40.2 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  44.97 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  39.19 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  40.14 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  42.28 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  38.94 
 
 		 442 aa  261  3e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  39.62 
 
 		 426 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  37.93 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.88 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.32 
 
 		 425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  38.44 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  35.12 
 
 		 457 aa  209  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  36.81 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.82 
 
 		 466 aa  206  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  31.8 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.57 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.83 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.93 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  40.1 
 
 		 437 aa  200  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.48 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.12 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  35.17 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.04 
 
 		 459 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.76 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  35.84 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 		 435 aa  196  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.01 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.71 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  35.44 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  38.05 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  34.37 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  38.3 
 
 		 425 aa  190  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  43.67 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  37.13 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  34.28 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.89 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  37.5 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.89 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.93 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.2 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  37.85 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  34.97 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  37.76 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.57 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  35.19 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  35.96 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  35.94 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  34.83 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  41.64 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  36.08 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>