183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1855 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  100 
 
 		 167 aa  339  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  93.71 
 
 		 167 aa  308  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  82.42 
 
 		 166 aa  286  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  54.04 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  53.66 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  52.17 
 
 		 161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  52.17 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  52.76 
 
 		 172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  49.07 
 
 		 164 aa  174  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  49.69 
 
 		 171 aa  173  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  49.07 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  47.2 
 
 		 170 aa  168  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  49.69 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.72 
 
 		 169 aa  164  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  45.34 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  46.91 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  45.34 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  45.68 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  45.34 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  50 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  45.34 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  45.34 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  47.83 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  42.24 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  45.96 
 
 		 174 aa  150  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  45.96 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  45.34 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  43.48 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  44.38 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  43.21 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  43.48 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  42.24 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  41.61 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  43.48 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  44.72 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  42.59 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  41.36 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  42.24 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  41.61 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  40.62 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  45.96 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  44.23 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  44.44 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  43.11 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  39.75 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  38.51 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  47.2 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  43.12 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  47.2 
 
 		 168 aa  134  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  43.48 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  40.61 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  39.39 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  43.04 
 
 		 477 aa  130  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  41.32 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  38.51 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  42.59 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  40.38 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  39.63 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  39.13 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  38.32 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  40 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  40 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  38.61 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  40 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  39.39 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  40 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  38.32 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7185  Ferroxidase  39.39 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  40 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  39.63 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  39.62 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  40 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  38.61 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  38.99 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  38.41 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  42.17 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  42.17 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  44.1 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1286  ferritin  38.75 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  35.85 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  35.44 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  35.44 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  35 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  35.44 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  35.44 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  35.44 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>