242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0558 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  40.09 
 
 		 1253 aa  855    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  42.31 
 
 		 1220 aa  766    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  28.89 
 
 		 1244 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0626  cobalamin biosynthesis protein  54.28 
 
 		 1379 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.941257 
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  39.52 
 
 		 1263 aa  786    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  39.97 
 
 		 1254 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  42.31 
 
 		 1220 aa  766    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  40.23 
 
 		 1254 aa  867    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  44.79 
 
 		 1209 aa  975    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.12 
 
 		 1262 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  40.66 
 
 		 1260 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  38.79 
 
 		 1259 aa  815    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  39.34 
 
 		 1273 aa  794    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  100 
 
 		 1453 aa  2946    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  44.02 
 
 		 1212 aa  944    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  40.26 
 
 		 1253 aa  854    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  46.27 
 
 		 1196 aa  983    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  41.15 
 
 		 1281 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  39.92 
 
 		 1257 aa  853    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  47.69 
 
 		 1222 aa  1076    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  46.09 
 
 		 1266 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  40.82 
 
 		 1269 aa  863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  45.54 
 
 		 1207 aa  993    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  38.72 
 
 		 1267 aa  850    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  40.82 
 
 		 1269 aa  869    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  38.19 
 
 		 1261 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  35.83 
 
 		 1256 aa  684    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  45.13 
 
 		 1207 aa  965    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  40.33 
 
 		 1270 aa  854    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.03 
 
 		 1242 aa  685    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  43.92 
 
 		 1203 aa  942    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.64 
 
 		 1245 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  36.83 
 
 		 1302 aa  773    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  40.29 
 
 		 1263 aa  917    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  45.46 
 
 		 1191 aa  1016    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  46.24 
 
 		 1206 aa  998    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  39.44 
 
 		 1240 aa  774    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  41.51 
 
 		 1278 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  42.9 
 
 		 1364 aa  958    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  39.97 
 
 		 1286 aa  797    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  53.41 
 
 		 1426 aa  1502    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  39.12 
 
 		 1263 aa  790    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  35.98 
 
 		 1255 aa  786    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  61.16 
 
 		 1435 aa  1796    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  43.86 
 
 		 1213 aa  987    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  37.76 
 
 		 1235 aa  768    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  40.84 
 
 		 1269 aa  850    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.95 
 
 		 1253 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  44.56 
 
 		 1198 aa  968    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  40.23 
 
 		 1267 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.34 
 
 		 1245 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  34.55 
 
 		 1220 aa  814    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  39.78 
 
 		 1247 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  41.57 
 
 		 1248 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  52.07 
 
 		 1444 aa  1399    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  83.36 
 
 		 1409 aa  2405    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  41.25 
 
 		 1269 aa  875    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  44.63 
 
 		 1198 aa  968    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  46.8 
 
 		 1237 aa  1065    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  37.98 
 
 		 1363 aa  916    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  45.67 
 
 		 1264 aa  1011    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  39.2 
 
 		 1290 aa  922    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  40.12 
 
 		 1270 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  42.17 
 
 		 1248 aa  870    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  37.85 
 
 		 1298 aa  768    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  41.25 
 
 		 1269 aa  875    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  42.11 
 
 		 1244 aa  929    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  38.03 
 
 		 1258 aa  818    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  44.32 
 
 		 1193 aa  971    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  38.05 
 
 		 1253 aa  864    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  43.84 
 
 		 1194 aa  976    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  37.92 
 
 		 1256 aa  845    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  40.14 
 
 		 1253 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  42.23 
 
 		 1175 aa  815    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  46.76 
 
 		 1238 aa  1044    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  36.29 
 
 		 1304 aa  718    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  45.02 
 
 		 1190 aa  938    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  48.13 
 
 		 1222 aa  1074    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  44.63 
 
 		 1198 aa  968    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  43.93 
 
 		 1205 aa  993    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  42.22 
 
 		 1220 aa  764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.21 
 
 		 1245 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  40.37 
 
 		 1348 aa  914    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.89 
 
 		 1245 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.99 
 
 		 1262 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  43.24 
 
 		 1199 aa  943    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  38.82 
 
 		 1249 aa  764    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  40.06 
 
 		 1253 aa  851    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  42.31 
 
 		 1220 aa  766    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  39.4 
 
 		 1293 aa  850    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  39.46 
 
 		 1263 aa  788    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  74.08 
 
 		 1406 aa  2120    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  41.15 
 
 		 1281 aa  848    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  41.08 
 
 		 1281 aa  849    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  33.68 
 
 		 1266 aa  632  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  33.47 
 
 		 1270 aa  625  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  30.91 
 
 		 1343 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  33.91 
 
 		 1297 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  28.1 
 
 		 1291 aa  545  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  30.63 
 
 		 1333 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>