26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2228 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  47.62 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  40.96 
 
 		 386 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  37.63 
 
 		 377 aa  222  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  34.15 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  35.2 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  35.2 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  34.87 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  35.55 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  35.55 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  34.13 
 
 		 393 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  30.79 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  33.78 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  31.79 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  32.21 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  30.71 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  31.27 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  35.69 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  23.99 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  30.14 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  30.14 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  25.48 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  28.52 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  31.63 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  28.5 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>