34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2085 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  74.82 
 
 		 141 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  38.89 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  37.24 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  41.27 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  38.58 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  38.46 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.67 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.67 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  37.69 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2868  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.48 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2489  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  31.68 
 
 		 491 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.78 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.36 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.43 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.06 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  23.77 
 
 		 395 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.46 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.46 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.46 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.46 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 536 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  31.21 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 202 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4667  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.46 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.02 
 
 		 202 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>