More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1647 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  100 
 
 
480 aa  934    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  87.9 
 
 
472 aa  794    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  67.31 
 
 
472 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  56.87 
 
 
463 aa  491  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  49.57 
 
 
443 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  47.36 
 
 
443 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  41.57 
 
 
426 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  43.57 
 
 
439 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  43.84 
 
 
429 aa  286  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.3 
 
 
954 aa  266  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  43.18 
 
 
441 aa  266  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.92 
 
 
924 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  39.95 
 
 
921 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  40.62 
 
 
470 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  40.62 
 
 
470 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  40.62 
 
 
470 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  39.31 
 
 
470 aa  249  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  40.05 
 
 
933 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  40.35 
 
 
457 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.52 
 
 
517 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  39.92 
 
 
469 aa  247  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  40 
 
 
493 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  39.71 
 
 
498 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  41.54 
 
 
405 aa  243  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  37.04 
 
 
468 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  37.56 
 
 
462 aa  239  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  36.71 
 
 
496 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  38.16 
 
 
470 aa  239  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  38.73 
 
 
459 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  38.22 
 
 
463 aa  236  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  37.85 
 
 
533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.47 
 
 
463 aa  233  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  36.71 
 
 
486 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  36.55 
 
 
459 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  40 
 
 
487 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  36.33 
 
 
469 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  36.23 
 
 
563 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  35.61 
 
 
529 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  39.23 
 
 
474 aa  226  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  39.01 
 
 
519 aa  226  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  38.9 
 
 
496 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  37.1 
 
 
460 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  37.42 
 
 
476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  37.22 
 
 
428 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  36.01 
 
 
422 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  37.21 
 
 
496 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  38.5 
 
 
435 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  38.57 
 
 
493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  39.65 
 
 
444 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  39.61 
 
 
494 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  36.22 
 
 
409 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  35.97 
 
 
475 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  36.22 
 
 
409 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  31.97 
 
 
414 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  36.74 
 
 
543 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  36.09 
 
 
487 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  35.33 
 
 
517 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.95 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  40.19 
 
 
473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  34.62 
 
 
659 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  32.47 
 
 
422 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  40.85 
 
 
364 aa  173  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  35.55 
 
 
367 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  39.16 
 
 
423 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  36.59 
 
 
972 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  34.34 
 
 
480 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  35.23 
 
 
481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  31.3 
 
 
368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  30.75 
 
 
368 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  37.99 
 
 
420 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  37.26 
 
 
371 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  34.69 
 
 
367 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  34.99 
 
 
395 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  35.11 
 
 
372 aa  156  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  29.06 
 
 
380 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  36.61 
 
 
424 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  34.8 
 
 
372 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  36.27 
 
 
365 aa  153  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  29.76 
 
 
400 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  32 
 
 
359 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.01 
 
 
374 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  32.7 
 
 
361 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  30.64 
 
 
412 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  29.94 
 
 
399 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  29.94 
 
 
399 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2010  stage V sporulation protein E  34.58 
 
 
368 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  32.08 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  32.68 
 
 
509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  32.23 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  32.23 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  32.23 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  36.52 
 
 
374 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.56 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1970  cell division protein FtsW  33.68 
 
 
423 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.212582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  32.47 
 
 
374 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  32.27 
 
 
376 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2049  cell division protein  33.68 
 
 
423 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0247231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  30.99 
 
 
400 aa  147  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  33.55 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>