83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0795 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  90.39 
 
 
261 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  87.9 
 
 
254 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  79.72 
 
 
285 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  75.51 
 
 
298 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  79.91 
 
 
334 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  80.28 
 
 
249 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  80.37 
 
 
264 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  80.09 
 
 
243 aa  358  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  46.81 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  36.08 
 
 
251 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  38.17 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  37.18 
 
 
281 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  43.58 
 
 
258 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  34.55 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  34.18 
 
 
265 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  34.98 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  30.88 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  32.43 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  88.24 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  29.46 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  30.28 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  29.55 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  32.51 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  32.57 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  29.88 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  28.52 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  33.92 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  28.38 
 
 
259 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  32.3 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  29.31 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  29.31 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  35.33 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2588  protein of unknown function DUF820  28.52 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186035  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  35.33 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  31.19 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  26.64 
 
 
240 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  87.18 
 
 
230 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  25.99 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  31.62 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  29.39 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  26.39 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  24.09 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  24.1 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  36.17 
 
 
232 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  28.75 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.91 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  31.16 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  23.74 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  36.41 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  27.84 
 
 
266 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  31.76 
 
 
229 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  81.82 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  30.6 
 
 
252 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  29.44 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  29.5 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  30.6 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  26.13 
 
 
239 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1377  protein of unknown function DUF820  26.61 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  25.95 
 
 
245 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  24.83 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  28.16 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  32.26 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  32.26 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  32.26 
 
 
249 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.87 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.87 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0816  hypothetical protein  50 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00128516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  25.53 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  24.77 
 
 
225 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  55.56 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  34.44 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0756  putative ribosomal protein L5-like protein  52.94 
 
 
359 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0450943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  36.21 
 
 
651 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  53.33 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  56.76 
 
 
227 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1940  Cold-shock protein DNA-binding protein  37.74 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>