63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3073 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3073  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  65.1 
 
 
265 aa  338  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  64.71 
 
 
265 aa  337  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0388  hypothetical protein  65.83 
 
 
227 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596384  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  54.62 
 
 
262 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0388  protein of unknown function DUF820  43.86 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3529  protein of unknown function DUF820  37.1 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0379  protein of unknown function DUF820  43.86 
 
 
256 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4546  protein of unknown function DUF820  37.7 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2988  hypothetical protein  42.77 
 
 
240 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00225611  normal  0.747663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2612  hypothetical protein  68.83 
 
 
89 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.852971  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3504  hypothetical protein  67.53 
 
 
89 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2588  protein of unknown function DUF820  43.33 
 
 
279 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186035  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0157  protein of unknown function DUF820  36.29 
 
 
257 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000154086  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1412  protein of unknown function DUF820  36.87 
 
 
274 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1441  protein of unknown function DUF820  36.87 
 
 
274 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  37.43 
 
 
265 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000553062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0161  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
257 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  38.01 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000078309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1193  hypothetical protein  71.21 
 
 
60 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  32.92 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  32.98 
 
 
281 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  32.98 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  27.09 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  34.98 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  32.79 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1876  hypothetical protein  86.67 
 
 
48 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  33.92 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  32.02 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  28.66 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  29.17 
 
 
245 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  28.27 
 
 
235 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  29.67 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  29.67 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  30.05 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  29.61 
 
 
334 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  32.91 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  29.67 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  29.06 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  29.49 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  85.71 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  27.6 
 
 
252 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  27.6 
 
 
252 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  34.03 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  31.16 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  30.38 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  31.61 
 
 
230 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  27.67 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  27.52 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  27.52 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  33.1 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  27.4 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  28.66 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  27.27 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  52.83 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  75 
 
 
229 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>