38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3652 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  100 
 
 		 393 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  96.69 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  36.52 
 
 		 490 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  39.06 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  31.49 
 
 		 439 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  31.39 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0618  hypothetical protein  87.5 
 
 		 60 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  27.47 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  26.38 
 
 		 781 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  27.4 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  25.1 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  24.67 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  29.82 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  24.27 
 
 		 659 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  26.87 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  34.81 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  34.81 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  34.07 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  34.43 
 
 		 624 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  29.55 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  23.14 
 
 		 649 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  23.06 
 
 		 466 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  26.24 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  27.82 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  24.68 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  22.91 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  24.51 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  26.28 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  29.55 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  29.55 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  24.91 
 
 		 645 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  24.91 
 
 		 645 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  24.91 
 
 		 645 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  25.44 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.21 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  23.49 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  25.19 
 
 		 405 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  24.89 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>