37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0035 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  257  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  98.5 
 
 		 177 aa  253  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  85.85 
 
 		 106 aa  185  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  46.46 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  44.44 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  43.69 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  43.69 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  42.45 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  42.42 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  42.72 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  39.36 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  41.41 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  43.43 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  42.42 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  44.68 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  41.41 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  44.68 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  40.2 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  42.57 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  34.69 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  42.34 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  41.44 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  36.04 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  27.84 
 
 		 209 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  39.73 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  30.21 
 
 		 292 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  30.33 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  29.75 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  29.75 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  43.1 
 
 		 302 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  38.36 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  39.39 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>