More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2506 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
109 aa  219  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  85.98 
 
 
110 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  85.05 
 
 
110 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  84.11 
 
 
110 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  83.18 
 
 
110 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  83.02 
 
 
110 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  82.52 
 
 
113 aa  177  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.95 
 
 
108 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.88 
 
 
109 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60 
 
 
108 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  60.95 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  60.95 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.1 
 
 
108 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.88 
 
 
108 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  54.63 
 
 
110 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.43 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.6 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.94 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.94 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.07 
 
 
108 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.85 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.66 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.6 
 
 
110 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
118 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.4 
 
 
114 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.66 
 
 
110 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.05 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.38 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
108 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  48.62 
 
 
108 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.36 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
110 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.87 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.36 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  45.79 
 
 
130 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  44.95 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
124 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
124 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
121 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  44.95 
 
 
117 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
121 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.04 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
124 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.12 
 
 
121 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  45.87 
 
 
116 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.12 
 
 
120 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
122 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
122 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  55.42 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47 
 
 
128 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  41.82 
 
 
113 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  49.54 
 
 
107 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5912  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
124 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106934  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
118 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
120 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
116 aa  104  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.46 
 
 
111 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
124 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
102 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.45 
 
 
110 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.12 
 
 
116 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
128 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
120 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  43.64 
 
 
117 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
130 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
124 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
124 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
128 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  47.57 
 
 
109 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
122 aa  100  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.99 
 
 
122 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.87 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1339  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.74 
 
 
130 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  44.86 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.48 
 
 
115 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
116 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002592  probable iron binding protein from the HesB_IscA_SufA family  44.34 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000217279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>