More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1470 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
308 aa  634  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  1.18267e-06 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  95.13 
 
 
308 aa  598  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  67.85 
 
 
307 aa  439  1e-122  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.74777e-09  unclonable  4.13669e-10 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.23 
 
 
293 aa  262  5e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.74 
 
 
293 aa  258  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  7.81607e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.95 
 
 
293 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.95 
 
 
293 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.91 
 
 
293 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.91 
 
 
293 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.95 
 
 
293 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  2.57617e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 
295 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.1349e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.91 
 
 
293 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.13 
 
 
293 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.63 
 
 
293 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.92 
 
 
293 aa  254  1e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.23 
 
 
293 aa  254  1e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.32 
 
 
296 aa  253  2e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  43.79 
 
 
311 aa  254  2e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 
293 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.23 
 
 
295 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 
295 aa  251  9e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.87 
 
 
295 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.18 
 
 
296 aa  250  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.42 
 
 
293 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.88 
 
 
290 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.61 
 
 
295 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.42 
 
 
295 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.09 
 
 
295 aa  246  5e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.43 
 
 
293 aa  244  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.61 
 
 
294 aa  244  1e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.43 
 
 
293 aa  244  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.2526e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.43 
 
 
306 aa  244  1e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.91055e-05  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3446  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.25 
 
 
298 aa  243  2e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.43 
 
 
292 aa  242  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.52 
 
 
292 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 
293 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.81 
 
 
295 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3697  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.07 
 
 
293 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.26 
 
 
293 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
293 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.98179e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3554  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.05 
 
 
293 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000257294  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03068  hypothetical protein  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0137973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4576  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.90936e-06  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3451  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.53069e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.51998e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03117  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.491501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3642  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.42217e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.38 
 
 
293 aa  236  5e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3575  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.25 
 
 
293 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12838  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3574  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.25 
 
 
293 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00265065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3646  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.92 
 
 
293 aa  233  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  decreased coverage  0.000138763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3681  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.55 
 
 
293 aa  233  4e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.463059  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.72 
 
 
289 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.92 
 
 
293 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.83 
 
 
294 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.88 
 
 
289 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.32 
 
 
299 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.14 
 
 
292 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.28 
 
 
294 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.39 
 
 
292 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.1 
 
 
292 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.95 
 
 
294 aa  216  6e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4862  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.92 
 
 
292 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4402  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.3 
 
 
292 aa  214  2e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0617  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.72 
 
 
292 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00809563  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.81 
 
 
292 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.67 
 
 
292 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.1 
 
 
303 aa  205  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.67 
 
 
292 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.35 
 
 
292 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.35 
 
 
292 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1047  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.72 
 
 
293 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.34 
 
 
295 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.48 
 
 
294 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  1.98415e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.49 
 
 
300 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.91 
 
 
296 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
293 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.04 
 
 
304 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.16 
 
 
301 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.45 
 
 
293 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.58 
 
 
302 aa  174  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.26 
 
 
300 aa  174  2e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.26 
 
 
300 aa  174  2e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  35 
 
 
300 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.94 
 
 
300 aa  172  6e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.94 
 
 
300 aa  172  6e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.94 
 
 
300 aa  172  6e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.94 
 
 
300 aa  172  6e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.94 
 
 
304 aa  172  6e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.39 
 
 
300 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.94 
 
 
300 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
300 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.83 
 
 
300 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.03 
 
 
298 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.77 
 
 
296 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>