More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0351 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  97.62 
 
 		 294 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  81.23 
 
 		 292 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  53.5 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  53.66 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  56.45 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  52.96 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  52.96 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  54.68 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  53.9 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  54.58 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  54.2 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  54.2 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  54.2 
 
 		 285 aa  278  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  52.84 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  53.52 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  53.19 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  53.19 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  57.19 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  53.19 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  51.77 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  51.93 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.47 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  50.52 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.93 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1349  elongation factor Ts  57.76 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1630  elongation factor Ts  57.55 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  50.86 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2640  elongation factor Ts  57.76 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024092  normal  0.161673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2707  elongation factor Ts  57.76 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000189418  normal  0.0108139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2814  elongation factor Ts  57.76 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000281155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  49.12 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  49.12 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1555  elongation factor Ts  56.88 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1271  elongation factor Ts  56.68 
 
 		 283 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000259112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2884  elongation factor Ts  56.47 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000033426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03236  elongation factor Ts  56.49 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  48.4 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2634  elongation factor Ts  55.6 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000554469  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3160  elongation factor Ts  56.16 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000947375  normal  0.213818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3280  elongation factor Ts  56.52 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141167  hitchhiker  0.0000739911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  48.25 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.96 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1446  elongation factor Ts  56.47 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2901  elongation factor Ts  56.47 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000344412  normal  0.175279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1482  elongation factor Ts  56.47 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000112791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1451  elongation factor Ts  56.47 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000175062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  47.48 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  48.01 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  48.29 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2426  elongation factor Ts  54.04 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  47.65 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1850  elongation factor Ts  55.4 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.95 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  47.65 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  45.92 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  47.29 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  47.29 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  47.29 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  47.29 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  47.29 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  48.4 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  46.93 
 
 		 293 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002747  translation elongation factor Ts  57.54 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000973884  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  47.31 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  47.65 
 
 		 294 aa  242  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  47.1 
 
 		 292 aa  241  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  46.08 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  46.08 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  48.62 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  48.62 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  46.4 
 
 		 293 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  47.5 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  49.46 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>