55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0454 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  45.27 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  45.32 
 
 		 197 aa  165  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  26.7 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  30.6 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  29.51 
 
 		 174 aa  62  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000206501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  31.74 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  35.16 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  32.2 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  27.37 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  26.92 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  32.53 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000825431  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  28.42 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820152  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  28.42 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  28.42 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  27.32 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000216707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  26.84 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  33.87 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  28.42 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000180096  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  28.42 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000235289  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  27.87 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  27.32 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  27.32 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000162111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  29.35 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  29.06 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  26.37 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  28.83 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  28.96 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000126789  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  33.86 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  27.07 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  26.92 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  26.78 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000529312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  30.94 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  29.57 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000408475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  34.53 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  29.35 
 
 		 175 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  31.25 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  30.43 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  31.06 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  27.32 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2915  protein of unknown function DUF177  24.1 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  33.87 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  31.3 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2186  hypothetical protein  25.12 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.111774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  28.89 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1809  protein of unknown function DUF177  27.03 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.870498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  30.25 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  27.93 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  25.71 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  36.97 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  32.32 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  28.23 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2236  hypothetical protein  28.92 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  22.65 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>