More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4465 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  89.98 
 
 
570 aa  997    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  75.97 
 
 
583 aa  875    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  65.49 
 
 
596 aa  717    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  61.03 
 
 
580 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  70.89 
 
 
586 aa  784    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  73.62 
 
 
595 aa  817    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  90.33 
 
 
570 aa  1004    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  89.98 
 
 
570 aa  997    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  100 
 
 
573 aa  1139    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  74.46 
 
 
579 aa  836    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  53.57 
 
 
590 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  52.41 
 
 
592 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  51.92 
 
 
590 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  49.73 
 
 
582 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  49.47 
 
 
575 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  47.11 
 
 
605 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  49.19 
 
 
585 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  50.7 
 
 
581 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.68 
 
 
610 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.5 
 
 
610 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  46.5 
 
 
610 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.5 
 
 
610 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  46.5 
 
 
610 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.5 
 
 
610 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.68 
 
 
610 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  47.42 
 
 
576 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  44.85 
 
 
576 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  42.17 
 
 
563 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  39.75 
 
 
578 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  38.55 
 
 
560 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  40 
 
 
574 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  39.02 
 
 
575 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  51.42 
 
 
497 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  40.29 
 
 
573 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  37.86 
 
 
568 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  37.86 
 
 
568 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  37.68 
 
 
568 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  35.03 
 
 
565 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  35.82 
 
 
574 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  39.22 
 
 
571 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  35.38 
 
 
585 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  35.7 
 
 
585 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  35.65 
 
 
585 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  35.32 
 
 
566 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  35.51 
 
 
585 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.37 
 
 
569 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.37 
 
 
569 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.39 
 
 
588 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  38.31 
 
 
587 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  35.03 
 
 
590 aa  300  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  33.97 
 
 
591 aa  299  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  34.48 
 
 
585 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  34.48 
 
 
585 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  36.05 
 
 
556 aa  294  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  34.48 
 
 
585 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  34.48 
 
 
585 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  33.39 
 
 
584 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  34.44 
 
 
569 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  30.59 
 
 
574 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  32.54 
 
 
579 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  32.54 
 
 
579 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  34.17 
 
 
576 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  33.46 
 
 
592 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  32.69 
 
 
588 aa  283  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.85 
 
 
572 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.53 
 
 
585 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  36.15 
 
 
569 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  37.1 
 
 
591 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  35.35 
 
 
559 aa  276  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.22 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  33.89 
 
 
567 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  34.72 
 
 
600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  31.29 
 
 
571 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  33.08 
 
 
578 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.29 
 
 
590 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  33.08 
 
 
592 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.75 
 
 
583 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.75 
 
 
605 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  31.86 
 
 
575 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  31.83 
 
 
585 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.15 
 
 
586 aa  250  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  35.53 
 
 
583 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.69 
 
 
592 aa  247  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  30.43 
 
 
570 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  30.7 
 
 
597 aa  238  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  27.91 
 
 
588 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  30.32 
 
 
570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.86 
 
 
578 aa  233  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  28.6 
 
 
565 aa  230  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  29.39 
 
 
567 aa  229  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  30.96 
 
 
572 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  30.6 
 
 
573 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33 
 
 
558 aa  227  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22210  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  31.33 
 
 
601 aa  223  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2603  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  32.27 
 
 
550 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  31.08 
 
 
557 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  30.22 
 
 
570 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  34.69 
 
 
573 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.31 
 
 
576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  30.61 
 
 
570 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>