24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3943 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 400 aa  811    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  32.84 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  32.6 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  34.57 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  32.19 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  32.19 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  32.93 
 
 		 465 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  37.23 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  32.17 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  31.77 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  36.17 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  29.23 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  39.79 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  32.1 
 
 		 433 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  33.81 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  30.18 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  27.49 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  32.25 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  28.67 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  24.81 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  25.5 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  28.4 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  26.97 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>