21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0217 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  953    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  50.86 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  50.21 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  59.16 
 
 		 243 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  36.89 
 
 		 482 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  33.16 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  25.38 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  27.89 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  27.79 
 
 		 324 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  41.07 
 
 		 199 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  26.54 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  24.71 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  27.52 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 86 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  40.51 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  26.47 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  38.16 
 
 		 131 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  40.28 
 
 		 152 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  44.93 
 
 		 87 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>