34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2863 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  774    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  50.15 
 
 
349 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  49.56 
 
 
349 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  51.33 
 
 
860 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  40 
 
 
341 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  34.2 
 
 
342 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  31.37 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  28.66 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  28.97 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  26.63 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  26.25 
 
 
337 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  26.25 
 
 
337 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  27.24 
 
 
338 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  25.99 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  27.11 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  24.02 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  25.14 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  24.72 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  26.69 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  29.33 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  27.87 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  28.78 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  26.18 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  24.33 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  26.07 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  23.99 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  24.91 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  23.86 
 
 
344 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  25.17 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  21.81 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  24.32 
 
 
357 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  23.87 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  24.19 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  21.94 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>