More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0868 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  100 
 
 
324 aa  670  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  76.64 
 
 
323 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  70.61 
 
 
319 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  68.04 
 
 
318 aa  465  1e-130  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  69.64 
 
 
311 aa  451  1e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  68.89 
 
 
321 aa  448  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  66.01 
 
 
322 aa  425  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  56.92 
 
 
325 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  56.92 
 
 
325 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  58.22 
 
 
324 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  57.05 
 
 
323 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  54.66 
 
 
323 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  57.89 
 
 
320 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  60.67 
 
 
320 aa  358  6e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.89 
 
 
330 aa  357  2e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.97 
 
 
322 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.59 
 
 
317 aa  354  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.26 
 
 
332 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.59 
 
 
334 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  52.9 
 
 
322 aa  343  3e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.46 
 
 
310 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  52.1 
 
 
348 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.94 
 
 
331 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  51.82 
 
 
310 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  52.75 
 
 
329 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  51.13 
 
 
332 aa  327  2e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  50.5 
 
 
310 aa  324  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  48.91 
 
 
333 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.61 
 
 
329 aa  321  1e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  51.29 
 
 
312 aa  320  2e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  50.17 
 
 
304 aa  314  1e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  49.83 
 
 
304 aa  313  3e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  47.54 
 
 
328 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  48.64 
 
 
304 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  48.8 
 
 
304 aa  309  3e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.53 
 
 
338 aa  308  1e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  46.73 
 
 
328 aa  307  2e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  50.65 
 
 
314 aa  307  2e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  48.37 
 
 
313 aa  302  4e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  45.42 
 
 
304 aa  285  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  45.85 
 
 
307 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.85 
 
 
304 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  47.85 
 
 
303 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  43.83 
 
 
315 aa  275  1e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.76 
 
 
301 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  41.37 
 
 
308 aa  266  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  41.83 
 
 
308 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  43.93 
 
 
304 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  45.93 
 
 
306 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.08382e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
304 aa  262  7e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.25089e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.72 
 
 
303 aa  261  9e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.63 
 
 
301 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  42.16 
 
 
331 aa  258  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  43.32 
 
 
308 aa  258  8e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.9 
 
 
341 aa  255  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.14 
 
 
298 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.64 
 
 
307 aa  254  1e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
301 aa  254  1e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.73 
 
 
323 aa  254  2e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.30693e-06  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  41.78 
 
 
306 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.75 
 
 
324 aa  253  4e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  44.97 
 
 
334 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  42.35 
 
 
304 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.05 
 
 
304 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.83 
 
 
311 aa  249  5e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.18 
 
 
303 aa  249  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  44.63 
 
 
334 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  40.91 
 
 
358 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  42.28 
 
 
304 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.76339e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  42.16 
 
 
305 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  44.3 
 
 
334 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  41.31 
 
 
304 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.96344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.57 
 
 
303 aa  246  5e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
304 aa  244  1e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
334 aa  244  2e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  40.86 
 
 
304 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.12 
 
 
320 aa  243  4e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  41.64 
 
 
302 aa  242  5e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  41.53 
 
 
304 aa  242  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  41.29 
 
 
326 aa  241  8e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.94 
 
 
306 aa  241  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  41.46 
 
 
318 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.14 
 
 
295 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  40.98 
 
 
302 aa  240  3e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  40.95 
 
 
323 aa  238  8e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  41.82 
 
 
337 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  41.82 
 
 
337 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  41.82 
 
 
337 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.33 
 
 
302 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.56 
 
 
462 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5730  quinolinate synthetase  40.25 
 
 
339 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  40.58 
 
 
302 aa  236  5e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.28992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  40.73 
 
 
306 aa  235  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.89 
 
 
347 aa  235  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  41.48 
 
 
365 aa  234  1e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  38.67 
 
 
335 aa  234  2e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0556  quinolinate synthetase  41.04 
 
 
305 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.87 
 
 
349 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  38.37 
 
 
332 aa  232  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  41.23 
 
 
379 aa  232  7e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>