More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0600 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  95.25 
 
 
379 aa  754    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  100 
 
 
379 aa  791    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  78.84 
 
 
395 aa  626  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2424  quinolinate synthetase  63.59 
 
 
378 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274031  hitchhiker  0.000442231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2553  quinolinate synthetase  63.32 
 
 
378 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5838  quinolinate synthetase  62.53 
 
 
378 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0776  quinolinate synthetase  62.53 
 
 
378 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0580  quinolinate synthetase  62.8 
 
 
376 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0813  quinolinate synthetase  62.89 
 
 
379 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1895  quinolinate synthetase  62.27 
 
 
378 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2506  quinolinate synthetase  62.27 
 
 
378 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  62.27 
 
 
382 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2236  quinolinate synthetase  62.53 
 
 
378 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.694626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3153  quinolinate synthetase  62.11 
 
 
379 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  0.197173 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2651  quinolinate synthetase  62.53 
 
 
378 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2531  quinolinate synthetase  62.27 
 
 
378 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.647299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0974  quinolinate synthetase  62.53 
 
 
378 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1026  quinolinate synthetase  62.53 
 
 
378 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0959109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0789  quinolinate synthetase  62.27 
 
 
391 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  normal  0.0932442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2105  quinolinate synthetase  62.53 
 
 
378 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1131  quinolinate synthetase  66 
 
 
350 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0978  quinolinate synthetase  62.27 
 
 
378 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  60.69 
 
 
384 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2737  quinolinate synthetase  61.21 
 
 
384 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.919283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  60.42 
 
 
382 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  60.42 
 
 
382 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2150  quinolinate synthetase  62.8 
 
 
377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0938  quinolinate synthetase  60.43 
 
 
377 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3497  quinolinate synthetase  60.78 
 
 
374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0545578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2820  quinolinate synthetase  60.78 
 
 
374 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1554  quinolinate synthetase  62.15 
 
 
371 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1928  quinolinate synthetase  62.57 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0143239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  63.16 
 
 
355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2243  quinolinate synthetase  62.28 
 
 
355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2015  quinolinate synthetase  59.83 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.332411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  59.39 
 
 
377 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  62.76 
 
 
355 aa  441  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51330  quinolinate synthetase  63.2 
 
 
352 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000717846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1888  quinolinate synthetase  61.11 
 
 
360 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2342  quinolinate synthetase  60.06 
 
 
357 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4393  quinolinate synthetase  62.61 
 
 
352 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2326  quinolinate synthetase  61.7 
 
 
355 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  60.24 
 
 
357 aa  434  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2232  quinolinate synthetase  60.53 
 
 
355 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011888  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  61.63 
 
 
352 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2281  quinolinate synthetase  61.29 
 
 
355 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.880932  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2025  quinolinate synthetase  60.06 
 
 
357 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  hitchhiker  0.0000127586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1950  quinolinate synthetase  60.06 
 
 
357 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.692849  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  64.42 
 
 
356 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2128  quinolinate synthetase  59.77 
 
 
357 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252809  hitchhiker  0.00117458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3850  quinolinate synthetase  59.94 
 
 
375 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1740  quinolinate synthetase  60.4 
 
 
352 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4505  quinolinate synthetase  60.53 
 
 
355 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2219  quinolinate synthetase  60.53 
 
 
355 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1712  quinolinate synthetase  61.29 
 
 
355 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0567053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2152  quinolinate synthetase  60.53 
 
 
355 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1231  quinolinate synthetase  59.14 
 
 
352 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2202  quinolinate synthetase  59.94 
 
 
360 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0931792  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1282  quinolinate synthetase  60.17 
 
 
352 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3981  quinolinate synthetase  59.43 
 
 
352 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  61.47 
 
 
345 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1901  quinolinate synthetase  60.81 
 
 
349 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  63.92 
 
 
378 aa  428  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0768  quinolinate synthetase  59.6 
 
 
375 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.68917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1260  quinolinate synthetase  59.14 
 
 
352 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720292  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1542  quinolinate synthetase  59.94 
 
 
352 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4397  quinolinate synthetase  58.74 
 
 
352 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4097  quinolinate synthetase  59.5 
 
 
374 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4187  quinolinate synthetase  58.86 
 
 
352 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152766  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003910  quinolinate synthetase  59.2 
 
 
353 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0026  quinolinate synthetase  60.47 
 
 
370 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0883  quinolinate synthetase  61.19 
 
 
347 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00857048  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3082  quinolinate synthetase  61.54 
 
 
353 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0534607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  59.14 
 
 
353 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00703  quinolinate synthetase  59.4 
 
 
347 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2892  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.4 
 
 
347 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0777  quinolinate synthetase  60.12 
 
 
347 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642145  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3959  quinolinate synthetase complex, subunit A  59.05 
 
 
352 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1426  quinolinate synthetase  59.48 
 
 
353 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1254  quinolinate synthetase  61.75 
 
 
353 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00563741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3071  quinolinate synthetase  61.11 
 
 
359 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0820  quinolinate synthetase  61.7 
 
 
347 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0928901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2898  quinolinate synthetase complex, A subunit  61.24 
 
 
349 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000238804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0852  quinolinate synthetase  59.7 
 
 
344 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000151704  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2912  quinolinate synthetase  59.4 
 
 
347 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00694281  normal  0.200335 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00692  hypothetical protein  59.4 
 
 
347 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0792  quinolinate synthetase  61.7 
 
 
347 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000157841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01614  quinolinate synthetase  58.62 
 
 
353 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0804  quinolinate synthetase  60.12 
 
 
347 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1282  quinolinate synthetase  61.14 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000716329  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0773  quinolinate synthetase  60.12 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000227851  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0915  quinolinate synthetase  61.4 
 
 
367 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0741807  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  64.74 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2953  quinolinate synthetase  60.84 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000127352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1103  quinolinate synthetase  59.89 
 
 
375 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0851  quinolinate synthetase  61.09 
 
 
367 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000370628  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2865  quinolinate synthetase  61.14 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1403  quinolinate synthetase  61.14 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0730  quinolinate synthetase  60.12 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0671  quinolinate synthetase  59.1 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>