41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3875 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 117 aa  229  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  71.43 
 
 		 111 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  64.6 
 
 		 111 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  56.73 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  60.58 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  60.58 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  53.92 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  51.46 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  62.04 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  56.86 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  45.54 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  44.55 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  43 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  41.67 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  41.67 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  41.28 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  42.2 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  40.54 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  42.2 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  43.56 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  40.54 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  42.2 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  43 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  44 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  40.74 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  41 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  31.11 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  31.43 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  24.77 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  27.37 
 
 		 108 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>