120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2137 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  775    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  70.47 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  70.03 
 
 		 402 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  71.06 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  67.36 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  53.9 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  51.99 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  53.56 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  54.93 
 
 		 415 aa  355  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  51.8 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  54.66 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  53.24 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  50.13 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  47.88 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  50.39 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  47.54 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  47.54 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  47.54 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  48.59 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  48.2 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  46.27 
 
 		 437 aa  315  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  49.62 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  47.33 
 
 		 399 aa  305  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2383  hypothetical protein  46.21 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  46.13 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  46.65 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  46.31 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2178  protein of unknown function DUF1006  44.53 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0894298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4005  hypothetical protein  45.45 
 
 		 408 aa  279  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2506  protein of unknown function DUF1006  47.3 
 
 		 432 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  43.34 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  42.49 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  46.13 
 
 		 428 aa  256  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  40.15 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  36.99 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2326  protein of unknown function DUF1006  43.38 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.193329  hitchhiker  0.00000627323 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  40.72 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  40.72 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  40.46 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  40.46 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  40.46 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  40.46 
 
 		 416 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  40.1 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  40.79 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  39.45 
 
 		 423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  40.3 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  38.54 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  39.13 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  38.29 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  38.29 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  40.06 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  38.44 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  39.5 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  39.5 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  37.34 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  39.23 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  38.95 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  39.39 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  37.22 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  37.7 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  38.48 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  38.23 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  38.32 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  37.94 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  37.94 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  38.56 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  38.8 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  38.8 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  38.8 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  38.8 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  38.8 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  38.8 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  37.47 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  38.3 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  38.3 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  34.34 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  35.11 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  33.58 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  33.91 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  34.76 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  35.82 
 
 		 406 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  35.16 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  32.67 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  34.18 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  34.18 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  34.55 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  33.43 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  35.07 
 
 		 399 aa  169  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  31.03 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  33.54 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  26.85 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  33.74 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  33.74 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  32.68 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  31.51 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  34.7 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  31.98 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  32.34 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  32.61 
 
 		 390 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  31.52 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>