40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1530 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  853    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  77.96 
 
 		 430 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  75.41 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  54.97 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  56.52 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  55.45 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  55.8 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  54.18 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  56.44 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  58.25 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  58.92 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  50.37 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  42.89 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  42.37 
 
 		 457 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  41.9 
 
 		 458 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  45.22 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  42.82 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 449 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  42.18 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  35.44 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  29.31 
 
 		 939 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  28.88 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  55.93 
 
 		 73 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  24.5 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  23.6 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.22 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  25.64 
 
 		 803 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  27.33 
 
 		 610 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54110  nucleotide transporter 5  29.31 
 
 		 547 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.779323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 513 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  23.2 
 
 		 666 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  31.93 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  29.7 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>