More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0020 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0020  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
88 aa  176  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0048  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  76.14 
 
 
88 aa  145  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0028  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  76.14 
 
 
88 aa  143  8e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  72.73 
 
 
88 aa  137  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0049  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  73.86 
 
 
88 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.116999  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0047  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  70.45 
 
 
88 aa  133  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0030  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  69.32 
 
 
88 aa  130  8e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00561191  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  46.15 
 
 
83 aa  70.9  5e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.59 
 
 
81 aa  70.5  7e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0337  H+-transporting two-sector ATPase, epsilon subunit  43.59 
 
 
80 aa  65.1  3e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3416  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  44.3 
 
 
80 aa  65.1  3e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0911  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  42.11 
 
 
78 aa  65.1  3e-10  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.14 
 
 
137 aa  64.7  4e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.26 
 
 
142 aa  63.9  6e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.65 
 
 
138 aa  63.5  9e-10  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.7 
 
 
132 aa  62.8  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.12 
 
 
134 aa  63.5  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0818  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.56 
 
 
93 aa  62  3e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.9 
 
 
134 aa  62  3e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
133 aa  61.2  4e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.71 
 
 
140 aa  60.8  6e-09  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
140 aa  60.5  7e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.44 
 
 
140 aa  60.1  1e-08  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.12 
 
 
134 aa  59.7  1e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  41.03 
 
 
80 aa  58.9  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01405  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.67 
 
 
92 aa  59.3  2e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.66 
 
 
137 aa  57.8  5e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1028  hypothetical protein  35.9 
 
 
82 aa  57.8  5e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.16 
 
 
133 aa  57.8  5e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.96 
 
 
140 aa  57.4  6e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  40.26 
 
 
87 aa  57.8  6e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.53 
 
 
135 aa  57  8e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  33.77 
 
 
134 aa  56.6  1e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2377  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.91 
 
 
134 aa  56.2  1e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
129 aa  56.6  1e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.71 
 
 
135 aa  56.6  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
141 aa  56.2  1e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  56.6  1e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.71 
 
 
135 aa  56.2  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.33 
 
 
139 aa  55.8  2e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.57 
 
 
133 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
130 aa  55.5  2e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
138 aa  55.5  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.68 
 
 
142 aa  55.8  2e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
142 aa  55.8  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
140 aa  55.1  3e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.44 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.84862e-08 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1563  ATP synthase F1, epsilon subunit  35 
 
 
134 aa  55.1  3e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000113638  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.17 
 
 
138 aa  55.5  3e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.16 
 
 
129 aa  55.1  3e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.5 
 
 
136 aa  55.1  3e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
132 aa  54.7  4e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 
134 aa  54.3  5e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
142 aa  54.7  5e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
138 aa  54.7  5e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.67 
 
 
139 aa  54.3  5e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
142 aa  54.7  5e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.36 
 
 
148 aa  54.3  5e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
142 aa  54.7  5e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
142 aa  53.9  6e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
142 aa  53.9  6e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  8.82186e-11 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
142 aa  53.9  6e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
142 aa  53.9  6e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
129 aa  53.9  7e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
129 aa  53.9  7e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  4.40039e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  37.66 
 
 
133 aa  53.9  7e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  36.36 
 
 
140 aa  53.9  7e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
133 aa  53.9  7e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
129 aa  53.9  7e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
85 aa  53.9  7e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0256  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
138 aa  53.9  7e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344579  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10040  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  34.18 
 
 
93 aa  53.9  8e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.51 
 
 
138 aa  53.9  8e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
132 aa  53.1  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
140 aa  53.5  1e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
129 aa  52.8  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
132 aa  53.5  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
135 aa  53.5  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
132 aa  53.1  1e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
134 aa  53.1  1e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.06 
 
 
140 aa  52.4  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.1 
 
 
133 aa  52.4  2e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.47 
 
 
139 aa  52.4  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.97 
 
 
139 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.21 
 
 
130 aa  52.4  2e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00211971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.57 
 
 
134 aa  52.4  2e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.86 
 
 
133 aa  52.8  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.05 
 
 
132 aa  52.4  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.26 
 
 
144 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.16 
 
 
134 aa  52.4  2e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1742  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  37.97 
 
 
141 aa  52.4  2e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.340723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0328  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
138 aa  52.8  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
135 aa  52.8  2e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
132 aa  52.4  2e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
137 aa  52  2e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.66 
 
 
136 aa  52.8  2e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.5 
 
 
142 aa  52  2e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1773  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.46 
 
 
92 aa  52.8  2e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.14 
 
 
133 aa  52.8  2e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.97005e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
132 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>