More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1425 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  100 
 
 
599 aa  1206    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21161  aspartate kinase  39.18 
 
 
588 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.926226  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  39.18 
 
 
588 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00821  aspartate kinase  40.49 
 
 
595 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  40.38 
 
 
601 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17741  aspartate kinase  39.74 
 
 
588 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3642  aspartate kinase  40.61 
 
 
604 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2221  aspartate kinase  40.64 
 
 
599 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18381  aspartate kinase  38.2 
 
 
586 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18571  aspartate kinase  37.87 
 
 
586 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137718  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0071  aspartate kinase  41.8 
 
 
601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  51.25 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1001  aspartate kinase  40.78 
 
 
616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  39.01 
 
 
599 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  49.75 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0068  aspartate kinase  40.72 
 
 
601 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1740  aspartate kinase  37.7 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18381  aspartate kinase  38.03 
 
 
586 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  39.17 
 
 
599 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  50.12 
 
 
414 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  50.5 
 
 
408 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  49.51 
 
 
408 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  50.5 
 
 
408 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  49.38 
 
 
412 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  48.5 
 
 
403 aa  389  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  50.75 
 
 
405 aa  389  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  49.01 
 
 
408 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  47.52 
 
 
424 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  47.63 
 
 
400 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  47.63 
 
 
400 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  47.52 
 
 
409 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  48 
 
 
400 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3519  aspartate kinase  54.17 
 
 
405 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  47.52 
 
 
412 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  49 
 
 
399 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  47.39 
 
 
411 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  50 
 
 
409 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  47.38 
 
 
400 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  49.13 
 
 
412 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  46.4 
 
 
410 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  46.4 
 
 
410 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  48.51 
 
 
410 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  52.5 
 
 
410 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0087  aspartate kinase  40.51 
 
 
604 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  47.28 
 
 
412 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  47.26 
 
 
405 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  46.65 
 
 
411 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  45.91 
 
 
428 aa  377  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  46.78 
 
 
406 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  48.51 
 
 
413 aa  379  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  47.41 
 
 
413 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  48 
 
 
399 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  46.78 
 
 
434 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  46.65 
 
 
411 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  46.65 
 
 
411 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  46.4 
 
 
411 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  46.52 
 
 
405 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  49.64 
 
 
424 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  49 
 
 
406 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  45.43 
 
 
428 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  48.9 
 
 
426 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  48.43 
 
 
410 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  48.75 
 
 
404 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  46.27 
 
 
401 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  48.77 
 
 
427 aa  375  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  47.64 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  48.16 
 
 
422 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  46.02 
 
 
427 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  49.75 
 
 
407 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  46.77 
 
 
407 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  50.12 
 
 
422 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  49.38 
 
 
409 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  48.39 
 
 
407 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  48.14 
 
 
404 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  47.51 
 
 
400 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  48.76 
 
 
416 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  49.64 
 
 
424 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  48.41 
 
 
411 aa  369  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  48.67 
 
 
417 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  47.68 
 
 
410 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  45.77 
 
 
427 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  46.06 
 
 
408 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  48.22 
 
 
435 aa  363  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  46.77 
 
 
405 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  48.39 
 
 
414 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  46.52 
 
 
404 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  48.5 
 
 
409 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  48.5 
 
 
409 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  48.25 
 
 
409 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  47.19 
 
 
409 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  48.18 
 
 
421 aa  360  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  44.94 
 
 
405 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  48.25 
 
 
409 aa  359  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  48.25 
 
 
409 aa  359  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  47.46 
 
 
424 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  48.29 
 
 
422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  45.19 
 
 
405 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  46.49 
 
 
418 aa  357  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  47.84 
 
 
446 aa  356  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  46.57 
 
 
409 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>