33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3610 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  332  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  52.98 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  56.58 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  54.9 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  54.25 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  50.62 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  56.86 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  52.63 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  55.56 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  50.32 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  45.7 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  47.02 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  53.29 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  47.24 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  46.79 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  43.11 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  46.36 
 
 		 151 aa  124  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  43.71 
 
 		 151 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  43.71 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  46.36 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  41.72 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  42.22 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  46 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  40.52 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  38.82 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  34.67 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  39.16 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  26.42 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>