More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2144 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  73.02 
 
 		 430 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  73.49 
 
 		 429 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  72.79 
 
 		 430 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  72.45 
 
 		 432 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  74.31 
 
 		 432 aa  663    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  69.7 
 
 		 430 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  71.4 
 
 		 430 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  70.7 
 
 		 430 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  70.7 
 
 		 430 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  73.49 
 
 		 429 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  100 
 
 		 430 aa  867    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  73.61 
 
 		 432 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  70.7 
 
 		 430 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  69 
 
 		 430 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  73.26 
 
 		 429 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  73.38 
 
 		 432 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  68.53 
 
 		 430 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  69 
 
 		 430 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  73.26 
 
 		 533 aa  660    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  71.4 
 
 		 430 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 		 430 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  69.93 
 
 		 457 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  72.09 
 
 		 430 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  72.69 
 
 		 432 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  70.79 
 
 		 429 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  72.79 
 
 		 448 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  71.63 
 
 		 448 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  68.76 
 
 		 430 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  70.53 
 
 		 431 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  69.77 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  69.61 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  67.98 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  67.75 
 
 		 431 aa  616  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  67.21 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  66.59 
 
 		 437 aa  605  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  66.05 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  68.07 
 
 		 428 aa  594  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  66.05 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 		 429 aa  589  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  66.28 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  64.88 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  53.99 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  57.81 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  57.81 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  57.81 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  56.88 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  58.74 
 
 		 432 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  57.81 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  57.34 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  54.67 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  54.44 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.67 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  53.7 
 
 		 436 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  52.42 
 
 		 435 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  52.22 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  52.18 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  50.91 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  51.03 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  52.76 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  51.22 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  51.72 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  50.58 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 430 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 431 aa  435  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>