More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3092 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
697 aa  1439    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.48 
 
 
704 aa  900    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  53.56 
 
 
696 aa  773    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  52.12 
 
 
720 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  53.7 
 
 
713 aa  780    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  52.17 
 
 
742 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.53 
 
 
757 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.05 
 
 
609 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  34.87 
 
 
602 aa  333  5e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.42 
 
 
697 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.51 
 
 
606 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  33.79 
 
 
607 aa  300  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  32.99 
 
 
605 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3155  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  32.01 
 
 
606 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  31.34 
 
 
796 aa  287  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3604  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  31.44 
 
 
614 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387306  normal  0.13043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  31.64 
 
 
548 aa  262  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  32.13 
 
 
552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  30.68 
 
 
550 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  31.73 
 
 
552 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  32.54 
 
 
568 aa  251  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  31.07 
 
 
556 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.74 
 
 
560 aa  250  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  31.52 
 
 
544 aa  249  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  31.92 
 
 
551 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  31.5 
 
 
559 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  31.93 
 
 
559 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.9 
 
 
544 aa  249  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.63 
 
 
550 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  31.93 
 
 
559 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  31.93 
 
 
559 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  29.84 
 
 
550 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  32.26 
 
 
543 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  30.88 
 
 
556 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  30.98 
 
 
557 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  29.84 
 
 
550 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  31.5 
 
 
559 aa  247  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  29.84 
 
 
550 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  31.02 
 
 
559 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  31.5 
 
 
559 aa  246  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  31.24 
 
 
556 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  31.02 
 
 
589 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  29.89 
 
 
550 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  31.2 
 
 
559 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.89 
 
 
551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.81 
 
 
551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.02 
 
 
552 aa  244  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  31.2 
 
 
559 aa  244  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  30.64 
 
 
559 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  30.7 
 
 
556 aa  243  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  30.88 
 
 
559 aa  243  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  29.77 
 
 
552 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  31.31 
 
 
551 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.48 
 
 
552 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.6 
 
 
557 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  31.68 
 
 
589 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  29.38 
 
 
551 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  30.66 
 
 
554 aa  241  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  31.25 
 
 
552 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  30.2 
 
 
552 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  28.07 
 
 
553 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.7 
 
 
560 aa  239  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  31.27 
 
 
556 aa  238  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  29.93 
 
 
569 aa  238  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  29.8 
 
 
556 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.95 
 
 
557 aa  238  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  31.08 
 
 
559 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  31.08 
 
 
559 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  31.08 
 
 
559 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  31.08 
 
 
559 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  31.08 
 
 
559 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.61 
 
 
556 aa  237  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  31.38 
 
 
556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.89 
 
 
550 aa  235  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2427  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.28 
 
 
602 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  31.11 
 
 
556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.23 
 
 
550 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.18 
 
 
561 aa  233  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  30.51 
 
 
553 aa  232  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  27.92 
 
 
605 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.92 
 
 
558 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.66 
 
 
556 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  28.85 
 
 
555 aa  231  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.02 
 
 
553 aa  230  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  28.08 
 
 
561 aa  229  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.87 
 
 
570 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.47 
 
 
564 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4652  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.08 
 
 
629 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  hitchhiker  0.00315368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  29.87 
 
 
557 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.02 
 
 
553 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  28.1 
 
 
552 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  30.6 
 
 
555 aa  228  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4515  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.15 
 
 
596 aa  228  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  28.89 
 
 
669 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.31 
 
 
551 aa  227  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  30.65 
 
 
557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2339  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.49 
 
 
608 aa  226  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.51 
 
 
557 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.29 
 
 
545 aa  224  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1795  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.57 
 
 
595 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.89784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>