217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1592 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 349 aa  698    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 349 aa  698    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  63.53 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  63.25 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  62.39 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  53.45 
 
 		 354 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  49.43 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  50.71 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  50.43 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  51.27 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  48.58 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  48.72 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  49.86 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  50.58 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  48.01 
 
 		 342 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  47.99 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  48.01 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  46.48 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  48.3 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  47.9 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  48.41 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.87 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  31.21 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  33.72 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.75 
 
 		 328 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.59 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.9 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  31.72 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.88 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  30.6 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.99 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  29.37 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  31.45 
 
 		 444 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  27.95 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  34.82 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  26.46 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  34.19 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.51 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  30.09 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.9 
 
 		 399 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  33.97 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  30 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.65 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  34.53 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  29.74 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  26.22 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.29 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  26.45 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  26.16 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  26.45 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  32.11 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  26.45 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  28.62 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  26.16 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  24.71 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  29.25 
 
 		 444 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.29 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  29.55 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  26.01 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  25.42 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  28.86 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  30.19 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  28.46 
 
 		 394 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  24.05 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  28.74 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.73 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  30.03 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  27.65 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  26.05 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  28.87 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.67 
 
 		 433 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  27.3 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  23.21 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.02 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  31.43 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  28.69 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.04 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1112  peptidase M19, renal dipeptidase  34.82 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0274447  hitchhiker  0.0050668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  37.11 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  26.4 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  27.56 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  27.27 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  28.89 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  27 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  26.74 
 
 		 420 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  27.76 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  30.18 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  28.66 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  26.59 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  31.75 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  26.98 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  34.94 
 
 		 602 aa  95.5  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  29.68 
 
 		 307 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  26.53 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  31.29 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>