More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0522 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3406  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.85 
 
 
182 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.92 
 
 
193 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.92 
 
 
193 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514998  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.45 
 
 
202 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.92 
 
 
217 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.37 
 
 
282 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0550797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.87 
 
 
295 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.7 
 
 
286 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.7 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.95 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.29 
 
 
224 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.73 
 
 
195 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.79 
 
 
193 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.89 
 
 
199 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.38 
 
 
223 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.86 
 
 
225 aa  157  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1095  hypothetical protein  51.28 
 
 
255 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1136  hypothetical protein  51.28 
 
 
237 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.93 
 
 
230 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.23 
 
 
204 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
267 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.59 
 
 
192 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.23 
 
 
204 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.7 
 
 
206 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.3 
 
 
248 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.58 
 
 
229 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.35 
 
 
344 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0473  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.59 
 
 
264 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0244617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.8 
 
 
264 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2497  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.8 
 
 
267 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.8 
 
 
264 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4027  twin-arginine translocation pathway signal  52.7 
 
 
206 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.51 
 
 
258 aa  148  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1754  hypothetical protein  52.7 
 
 
269 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.518871  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.98 
 
 
232 aa  147  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.75 
 
 
212 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0400  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.7 
 
 
269 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  53.62 
 
 
342 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.62 
 
 
342 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.62 
 
 
240 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.66 
 
 
160 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
200 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686516  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  51.45 
 
 
241 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  51.45 
 
 
241 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  49.66 
 
 
206 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.75 
 
 
249 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.31 
 
 
305 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.52 
 
 
255 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.71 
 
 
205 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.72 
 
 
206 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.31 
 
 
305 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  49.08 
 
 
244 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0761  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.41 
 
 
249 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  49.69 
 
 
313 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.65 
 
 
307 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  48.98 
 
 
206 aa  140  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0619  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.17 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66713  normal  0.167161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4932  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.24 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0398  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.02 
 
 
246 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.177632 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5810  hypothetical protein  45.21 
 
 
266 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.55 
 
 
241 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.05 
 
 
249 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.32 
 
 
247 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5998  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.92 
 
 
212 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765606  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3598  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.7 
 
 
221 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594439  normal  0.12485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.03 
 
 
269 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.7 
 
 
221 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.71 
 
 
271 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2457  hypothetical protein  44.72 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.28 
 
 
263 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0523  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.65 
 
 
260 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.457346  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1873  hypothetical protein  48.65 
 
 
293 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.09 
 
 
214 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  51.45 
 
 
219 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3870  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.91 
 
 
257 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0939038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.91 
 
 
224 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.21 
 
 
225 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.21 
 
 
225 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.48 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0218873  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1336  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.35 
 
 
262 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.71 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1167  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.24 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.58 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.55 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1783  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.98 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2711  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.17 
 
 
219 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1391  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.55 
 
 
252 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3987  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.76 
 
 
227 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.98 
 
 
231 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.78 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1269  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.89 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090481  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1371  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.28 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4701  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493501  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.03 
 
 
316 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269032  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0061  hypothetical protein  48.46 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.92 
 
 
224 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.28 
 
 
239 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239202  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4697  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.92 
 
 
224 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0835735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>