More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4112 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3406  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.68 
 
 
182 aa  221  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0902  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  64.05 
 
 
286 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0133  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.26 
 
 
295 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  61.29 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.26 
 
 
282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0550797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.09 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.71 
 
 
224 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4144  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.69 
 
 
282 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1072  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.97 
 
 
225 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  60 
 
 
226 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4415  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  58.02 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1136  hypothetical protein  54.55 
 
 
237 aa  188  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1095  hypothetical protein  54.55 
 
 
255 aa  188  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.38 
 
 
193 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.06 
 
 
223 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.87 
 
 
193 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.87 
 
 
193 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0514998  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.87 
 
 
230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0473  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.42 
 
 
264 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0244617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1092  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.51 
 
 
204 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.193233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.74 
 
 
192 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0943  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.53 
 
 
204 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.32 
 
 
232 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.11 
 
 
267 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4027  twin-arginine translocation pathway signal  55.48 
 
 
206 aa  174  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.75 
 
 
229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160415  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.41 
 
 
274 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.78 
 
 
271 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1682  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.77 
 
 
264 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2001  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.77 
 
 
264 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.35 
 
 
248 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.72 
 
 
255 aa  167  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  55.63 
 
 
244 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2699  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.73 
 
 
238 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0453  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.94 
 
 
258 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.114035 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  54.97 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.37 
 
 
228 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66713  normal  0.167161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0500  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.95 
 
 
230 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.74 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0859  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.4 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0564  hypothetical protein  48.1 
 
 
238 aa  160  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5811  hypothetical protein  48.7 
 
 
223 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0302  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
305 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.833959  normal  0.0865771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.15 
 
 
228 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0346  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
305 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590288  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.13 
 
 
266 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3032  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.45 
 
 
249 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
307 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.404178  normal  0.998145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2497  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.66 
 
 
267 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.13 
 
 
249 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1186  hypothetical protein  49.37 
 
 
254 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.9 
 
 
212 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_004310  BR0139  putative lipoprotein  46.41 
 
 
206 aa  158  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1585  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.8 
 
 
344 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219191  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0398  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.92 
 
 
246 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.177632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1187  hypothetical protein  48.1 
 
 
251 aa  158  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4115  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.68 
 
 
184 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.9 
 
 
160 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0400  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.66 
 
 
269 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1754  hypothetical protein  57.66 
 
 
269 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.518871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.96 
 
 
316 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269032  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0243  putative lipoprotein  47.75 
 
 
342 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.955469  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0808  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.73 
 
 
244 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.95 
 
 
200 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686516  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4038  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 
206 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0133  putative lipoprotein  46.41 
 
 
206 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1886  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.75 
 
 
342 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0575  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.73 
 
 
227 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3056  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.38 
 
 
240 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.47 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.47 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.2 
 
 
231 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0921  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.41 
 
 
244 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288984  normal  0.162173 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5810  hypothetical protein  48.04 
 
 
266 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2711  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.61 
 
 
219 aa  154  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1873  hypothetical protein  49.1 
 
 
293 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2851  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.97 
 
 
214 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0523  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.1 
 
 
260 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.457346  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.39 
 
 
192 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.152699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4348  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.68 
 
 
243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5015  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.45 
 
 
226 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6969  hypothetical protein  47.62 
 
 
219 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4192  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.73 
 
 
220 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0501  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
249 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0807  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.17 
 
 
268 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0660  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.11 
 
 
260 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.934549  normal  0.201903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.92 
 
 
267 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_004310  BR0050  putative lipoprotein  46.45 
 
 
241 aa  148  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0049  putative lipoprotein  46.45 
 
 
241 aa  148  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0055  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.45 
 
 
241 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0920  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.91 
 
 
268 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00634129  normal  0.159547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4672  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.43 
 
 
201 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.497967  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3879  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.4 
 
 
205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.06 
 
 
283 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.57 
 
 
263 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3877  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
238 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0706  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG domain-containing protein  47.43 
 
 
197 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1167  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.39 
 
 
224 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3587  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.14 
 
 
257 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>