58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1187 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  54.3 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  30.16 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  31.08 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  30.16 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  30.95 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  27.6 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  28.57 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  26.78 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  26.78 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.18 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  26.59 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  27.39 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  24.91 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  24.69 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.42 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  25.42 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  24.27 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  24.27 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  24.4 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  24.4 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  23.01 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  23.01 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  24.6 
 
 		 221 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>