182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2555 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  100 
 
 
174 aa  360  5e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.56866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  51.19 
 
 
168 aa  179  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  3.23257e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  52.8 
 
 
162 aa  176  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.20076e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  54.17 
 
 
171 aa  175  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  49.4 
 
 
171 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  49.13 
 
 
177 aa  175  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  52.69 
 
 
169 aa  172  2e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  48.24 
 
 
164 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  43.79 
 
 
172 aa  163  1e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  45.88 
 
 
170 aa  163  1e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  50.62 
 
 
164 aa  163  1e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  47.59 
 
 
172 aa  163  1e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48628e-10 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  46.2 
 
 
171 aa  163  1e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  47.59 
 
 
172 aa  162  2e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  46.91 
 
 
166 aa  161  4e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  48.45 
 
 
161 aa  160  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  44.12 
 
 
176 aa  160  8e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  48.52 
 
 
172 aa  158  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  44.38 
 
 
173 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.53889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  46.3 
 
 
163 aa  155  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.82999e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.64 
 
 
169 aa  155  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  154  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  hitchhiker  1.91654e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  51.5 
 
 
168 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  153  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  46.25 
 
 
163 aa  153  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  49.37 
 
 
164 aa  153  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  4.4787e-12 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  46.58 
 
 
163 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.63521e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  47.2 
 
 
163 aa  152  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  44.85 
 
 
168 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.92038e-05  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  50.9 
 
 
168 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  43.64 
 
 
171 aa  152  3e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.23127e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  45.51 
 
 
170 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.20561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  45.28 
 
 
167 aa  151  6e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  50.3 
 
 
168 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.5071e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  49.1 
 
 
186 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  5.12633e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  44.1 
 
 
164 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  45.96 
 
 
165 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  45.51 
 
 
170 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.19081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  44.44 
 
 
173 aa  148  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.65061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  45.91 
 
 
167 aa  148  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  45.62 
 
 
160 aa  145  4e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.33256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  41.52 
 
 
175 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  41.82 
 
 
168 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  47.2 
 
 
162 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  43.03 
 
 
175 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  43.64 
 
 
175 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  42.94 
 
 
169 aa  139  2e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  42.86 
 
 
173 aa  139  2e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  42.01 
 
 
176 aa  137  9e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.24545e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  44.64 
 
 
171 aa  135  3e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  44.05 
 
 
175 aa  131  4e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  40.74 
 
 
162 aa  130  1e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  44.81 
 
 
168 aa  129  2e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  36.69 
 
 
175 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  36.42 
 
 
174 aa  127  1e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  38.75 
 
 
175 aa  126  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  42.86 
 
 
164 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  39.52 
 
 
170 aa  125  4e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  44.17 
 
 
166 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  44.17 
 
 
166 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  36.09 
 
 
175 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  38.12 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  38.12 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  38.12 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  42.77 
 
 
164 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  38.12 
 
 
175 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  36.48 
 
 
175 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  38.36 
 
 
165 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  36.84 
 
 
178 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  37.43 
 
 
178 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  36.84 
 
 
178 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  36.84 
 
 
178 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  36.84 
 
 
178 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  36.84 
 
 
178 aa  120  1e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 
172 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  37.27 
 
 
167 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  36.21 
 
 
175 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  38.22 
 
 
159 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  37.5 
 
 
175 aa  116  1e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  41.77 
 
 
477 aa  115  2e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  37.72 
 
 
170 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.39627e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  37.11 
 
 
181 aa  114  8e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  35.88 
 
 
172 aa  113  1e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  41.72 
 
 
166 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  38.89 
 
 
165 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  36.31 
 
 
168 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  35.22 
 
 
175 aa  112  4e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  35 
 
 
175 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  37.5 
 
 
168 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  35.4 
 
 
173 aa  110  8e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0920  ferritin like protein 1  35.44 
 
 
161 aa  110  1e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0864948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  36.69 
 
 
169 aa  109  2e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  33.96 
 
 
165 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  1.16181e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2003  ferritin  33.96 
 
 
165 aa  108  4e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.4289e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01873  ferritin iron storage protein (cytoplasmic)  33.96 
 
 
165 aa  108  4e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00913227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>